خشکسالی یک ناهماهنگی موقت اقلیمی است و با خشکی متفاوت است. خشکسالی دوره زمانی است که طی آن آب قابل دسترس به طور قابل توجهی پایین تر از حد معمول است. خشکسالی تقریباً در تمام نواحی اقلیمی رخ می دهد، ولی ویژگی های آن از ناحیه ای به ناحیه دیگر بطور محسوسی متفاوت است. کشاورزی در مناطق خشک با شرایط دمای نامناسب و بارش کم مانند استان یزد بسیار دشوار است ولی هنوز هم به عنوان یک منبع مهم تولید و کارآفرین به آن نگریسته می شود. یکی از فاکتورهای تعیین شده در براورد آب مورد نیاز اراضی کشاورزی، الگو و ترکیب کشت آنها می باشد. بنابراین یکی از موارد مهم و تاثیرگذار در این زمینه، هماهنگی الگوی کشت در این مناطق با پدیده خشکسالی است. 

در این تحقیق، مناطق آسیب پذیر از خشکسالی در استان از طریق مدل زنجیره مارکف تعیین شد. مناطق در معرض تبخیر و تعرق شدید نیز با استفاده از روش پنمن-ماتیث مشخص شد و سپس با تعیین نیاز آبی گیاهان زراعی استان، اولویت گیاهان مختلف برای قرارگرفتن در ترکیب کشت شهرستان های استان مشخص شد. در پایان با استفاده از تکنیک شبکه های عصبی مصنوعی، قابلیت پیش بینی خشکسالی در مناطق خشک مانند استان یزد و کاربرد آن در زمینه تعیین الگوی کشت سال آینده بررسی شد.